Setor que visa garantir que os parâmetros pré-estabelecidos para o processamento (materiais seguramente limpos, desinfectados/esterilizados, livres de biofilmes, endotoxinas e outros pirógenos e substâncias torácicas utilizadas no processamento) foram atingidos e que são reproduzíveis, conferindo segurança na prática utilizada.

 Classificação  do CME conforme RDC 15 DE 2002:

• Classe 1: Onde realiza o processamento de produtos para sáude não críticos, semi críticos e críticos de conformação não complexa passíveis de processamento.

• Classe 2: Aquele que realiza o processamento de produtos para sáude não críticos, semi críticos e críticos de conformação complexa e não complexa passíveis de processamento.

     Assim o CME ​só poderá processar artigos que sejam compatíveis com a sua capacidade técnica operacional e de acordo com a sua classificação.

     Os 5 setores que uma CME de classe 1 e 2 tem que ter minimamente:

Recepção e limpeza,Preparo e esterilização ,Desinfecção quimica quando aplicável ,4 Local para monitorização do processo estéril ,Armazenamento e distribuição do material                                                                     

 O fluxo dos funcionários e de materiais na CME  deve ser unidirecional e de fluxo contínuo,para evitar o cruzamento de material sujo com material esterelizado, O trabalhador deve transitar da área suja para limpa ou vice e versa, sem o devido cuidado de retirada dos epis e higienização das mãos , a existência de barreiras físicas auxiliam no fluxo unidirecional.